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제2조(개항 및 항계)
①법 제3조의 규정에 의한 개항은 다음 각호와 같다. [개정 1995.12.29, 1997.12.8, 1998.2.24, 2004.12.30 제18624호(항만법시행령)]
1. 부산항
2. 인천항
3. 평택·당진항
4. 마산항
5. 통영항
6. 삼천포항
7. 장승포항
8. 진해항
9. 옥포항
10. 동해항
11. 묵호항
12. 삼척항
13. 울산항
14. 군산항
15. 장항항
16. 대산항
17. 목포항
18. 완도항
19. 여수항
20. 광양항
21. 포항항
22. 제주항
23. 고현항
24. 속초항
25. 옥계항
26. 보령항
27. 서귀포항
28. 태안항
②제1항의 규정에 의한 개항의 항계는 항만법시행령 별표1의 해상구역과 같다. [개정 2003.06.05]

부칙
이 영은 공포한 날부터 시행한다.

부칙 [94·12·23]
제1조 (시행일) 이 영은 공포한 날부터 시행한다. [단서 생략]
제2조 내지 제5조 생략

부칙 [95·12·29]
제1조 (시행일) 이 영은 공포한 날부터 시행한다.
제2조 내지 제4조 생략

부칙 [96·8·8]
제1조 (시행일) 이 영은 공포한 날부터 시행한다.
제2조 내지 제8조 생략

부칙 [97·5·24]
제1조 (시행일) 이 영은 공포한 날부터 시행한다.
제2조 내지 제6조 생략

부칙 [97·12·8]
이 영은 공포한 날부터 시행한다.

부칙 [98·2·24]
①(시행일) 이 영은 공포한 날부터 시행한다.
②(총사업비중 공사비의 산정에 관한 적용례) 제18조제3호의 개정규정은 이 영 시행후 허가받은 항만공사의 시행자부터 적용한다.
③생략

부칙 [99·7·23]
①(시행일) 이 영은 공포한 날부터 시행한다. 다만, 제13조의2·제16조 및 별표 4 제3호의 개정규정은 1999년 8월 9일부터 시행한다.
②(과태료에 관한 경과조치) 이 영 시행전에 위반행위에 대한 과태료의 부과에 관하여는 종전의 규정에 의한다.

부칙 [99·8·23]
제1조 (시행일) 이 영은 공포한 날부터 시행한다.
제2조 생략

부칙 [2003.06.05.]
이 영은 2003년 6월 12일부터 시행한다.

부칙 [2004.1.29. 대통령령 제18254호(해양수산부와그소속기관직제)]
제1조 (시행일) 이 영은 공포한 날부터 시행한다.
제2조 생략
제3조 (다른 법령의 개정) ①내지 ③생략
④개항질서법시행령중 다음과 같이 개정한다.
제4조제1항제1호중 "출장소"를 "해양수산사무소"로 한다.
⑤내지 ⑦생략

부칙 [2004.3.17]
이 영은 공포한 날부터 시행한다.

부칙 [2004.12.30 제18624호(항만법시행령)]
제1조(시행일) 이 영은 공포한 날부터 시행한다.
제2조(다른 법령의 개정) ①개항질서법시행령중 다음과 같이 개정한다.
제2조제1항제3호를 다음과 같이 한다.
3. 평택·당진항
②생략

부칙 [2007.9.28 제20300호(선박안전법 시행령)]
제1조(시행일) 이 영은 2007년11월 4 일부터 시행한다.
제2조 내지 제5조 생략
제6조(다른 법령의 개정) ①개항질서법시행령 일부를 다음과 같이 개정한다.
제16조 각 호 외의 부분 단서를 다음과 같이 한다.
다만, 「항만법」, 「공유수면관리법」 또는 「공유수면매립법」에 따라 지방해양수산청장의 허가 또는 면허를 받은 공사 또는 작업을 제외한다.
제17조제1항제6호 중 “선박안전법 제16조의2제4항의 규정에 의한 지정검사기관”을 “「선박안전법」 제65조제1항에 따른 위험물검사등대행기관”으로 한다.
② 내지 ⑮ 생략
제7조 생략

부칙 [2008.2.29 제20722호(국토해양부와 그 소속기관 직제)]
제1조(시행일) 이 영은 공포한 날부터 시행한다. 다만, 부칙 제6조에 따라 개정되는 대통령령 중 이 영의 시행 전에 공포되었으나 시행일이 도래하지 아니한 대통령령을 개정한 부분은 각각 해당 대통령령의 시행일부터 시행한다.
제2조부터 제5조까지 생략
제6조(다른 법령의 개정) ① 및 ② 생략
③ 개항질서법시행령 일부를 다음과 같이 개정한다.
제4조제1항제1호·제2호, 제7조제1항, 제9조제1항, 제16조제3호, 제18조제4항 및 별표 4 제14호 중 "해양수산부령"을 각각 "국토해양부령"으로 한다.
제4조제1항제1호 중 "관할지방해양수산청장(지방해양수산청장소속하에 두는 해양수산사무소의 장을 포함한다. 이하 "지방해양수산청장"이라 한다)"을 "관할지방해양항만청장(지방해양항만청장 소속하에 두는 해양사무소의 장을 포함한다. 이하 "지방해양항만청장"이라 한다)"으로 한다.
제4조제1항제2호·제3항·제4항·제5항 본문, 제5조제3호, 제6조제1항, 제7조제1항, 제8조 본문, 제9조제1항·제2항, 제10조제1항제3호·제2항, 제11조제2항, 제13조의2제1항제11호, 제15조제1항 전단·제2항·제3항 각 호 외의 부분·제4항, 제16조 각 호 외의 부분 단서, 제17조제1항 각 호 외의 부분, 제18조제1항·제2항 전단 및 제3항 단서 중 "지방해양수산청장"을 각각 "지방해양항만청장"으로 한다.
제4조제1항 각 호 외의 부분 단서 및 제6조제1항·제2항 중 "해양수산부장관"을 각각 "국토해양부장관"으로 한다.
제17조제1항제1호·제2호·제3호 및 제4호 중 "해양수산관서"를 각각 "해양항만관서"로 한다.
④ 부터 <138> 까지 생략

부 칙[2009.7.30 제21648호(남북교류협력에 관한 법률 시행령)]
제1조(시행일) 이 영은 2009년 7월 31일부터 시행한다.
제2조부터 제7조까지 생략
제8조(다른 법령의 개정) ① 생략
② 개항질서법 시행령 일부를 다음과 같이 개정한다.
제7조제3항 중 “남북교류협력에관한법률에 의하여”를 “「남북교류협력에 관한 법률」에 따라”로, “동법시행령 제45조의 규정에 의한”을 “같은 법 시행규칙에서 정하는 바에 따라 발급받은”으로 한다.
③ 생략
제9조 생략